广州医科大学2022年入选国家“双一流”建设高校名单，现有“双一流”建设学科1个，广东省高等教育“冲一流、补短板、强特色”提升计划重点建设学科5个。建有国家重点学科1个，国家中医药管理局重点学科1个，广东省重点学科6个，广东省医学重点学科5个，广东省中医药局重点学科1个，广州市教育局重点学科14个，广州市医学重点学科15个。ESI全学科排名内地高校百强，10个学科进入全球前1%，其中临床医学进入前1‰。